Laureato, entrò nella carriera delle biblioteche dal 1º giugno 1863.
Lavorò, probabilmente per tutta la carriera, alla Biblioteca universitaria di Padova. La Biblioteca era allora diretta da un docente dell'Ateneo, ma il Girardi ne fu probabilmente responsabile fin dal principio degli anni Settanta. Nel 1872, infatti, pubblicò la relazione ufficiale su di essa per l'Esposizione internazionale di Vienna. Divenne formalmente direttore della Biblioteca dal 1884.
Nell'agosto 1893 venne promosso bibliotecario di prima classe ma due anni dopo, con la soppressione delle qualifiche di prefetto, venne inquadrato nella 4ª classe, e poi nel giugno 1900 promosso alla 3ª classe.
Chiese di essere collocato a riposo, compiuti i quarant'anni di servizio, dal 1º ottobre 1903.
Compilò con P. A. Saccardo l'Indice generale per ordine alfabetico di autori e di materie dei lavori letti alla R. Accademia di scienze, lettere ed arti in Padova e pubblicati ne' suoi atti dall'anno 1779 a tutto l'anno accademico 1899-1900 con brevi notizie biografiche (1901).